Databases
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KRA 바로가기 (Korea sequence Read Archive)
차세대 염기서열 분석(NGS ; Next Generation Sequencing)은 유전체 염기서열의 고속 분석방법입니다. NGS 시퀀서를 통해 생산된 Read 데이터 및 이들의 추가 분석을 통해 얻어진 Alignment, Quantification, Variant 등의 가공 데이터를 등록 및 다운로드할 수 있습니다.
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KEA 바로가기 (Korea Expression Archive)
Korea Expression Archive (KEA) 는 마이크로어레이, 전사체, 단일 세포 유전체, 공간 전사체, 후성유전체 분석 등 Array기반 및 Sequencing기반 실험에서 생성된 기능유전체 데이터를 저장하는 저장소입니다
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KNA 바로가기 (Korea Nucleotide Archive)
염기서열(Nucleotide sequence) 데이터는 다양한 방법의 시퀀싱 및 in silico 방법으로 얻어지는 염기서열 및 이의 특성/기능 정보를 포함합니다. 단일 염기서열, 조립된 유전체/전사체, 유전체 annotation 정보 및 해당 유전자의 단백질 서열정보 등의 데이터를 등록 및 다운로드 할 수 있습니다.
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KVar 바로가기 (Korea Variant Archive)
유전체 변이(Genomic variation) 데이터는 염기서열 분석을 통해 확인된 단일염기다형성(SNP), 삽입/결실(InDel), 구조 변이(SV), 복제수 변이(CNV) 등의 정보를 포함합니다. 특히 SNP는 집단 단위 변이 정보와 대립 유전자 빈도(allele frequency)를 제공합니다. 원시 변이 파일(VCF), 주석 처리된 변이 데이터, 대립 유전자 빈도 테이블 등의 데이터를 등록 및 다운로드할 수 있습니다.
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KSO 바로가기 (Korea Spatial Omics)
공간 오믹스는 조직 내 유전자 발현을 공간적 구조와 함께 분석하는 방법입니다. 전사체, 단백체, 대사체 등 다양한 오믹스 데이터를 포함하며, 원시 데이터와 전사체 발현 행렬, 세포 분할 정보, 공간 좌표 등의 가공 데이터를 등록 및 다운로드할 수 있습니다.
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KPOP 바로가기 (Korea ProteOme rePository)
단백체 정량 분석(Quantitative Proteomics)은 생체 시료에서 발현되는 단백질들을 총체적으로 동정하고 발현량을 정량화하는 방법이며, 주로 질량분석법(Mass Spectrometry) 장비가 사용됩니다. 질량분석 장비를 통해 생산된 원시(Raw) 데이터 및 이들의 추가 분석을 통해 얻어진 정량 값 데이터 등의 가공 데이터를 등록 및 다운로드할 수 있습니다.
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KMAP 바로가기 (Korea MetAbolomics data rePository)
대사체학(Metabolomics)은 생체 시료 내의 대사산물(Metabolite)들을 총체적으로 동정하고 정량화하는 방법이며, 주로 질량분석법(Mass Spectrometry) 및 핵자기공명(Nuclear Magnetic Resonance) 장비가 사용됩니다. 이를 통해 생산된 원시(Raw) 데이터 및 이들의 추가 분석을 통해 얻어진 정량 값 데이터 등의 가공 데이터를 등록 및 다운로드할 수 있습니다.
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KCODE 바로가기 (Korea Chemical Oriented Database Entity, Compound)
대상 타겟에 대한 화합물의 활성 실험(Bioassay) 결과 데이터, 화합물의 화학적 구조 및 스펙트럼 특성 데이터, 화합물을 활용하여 실시한 약효 평가 데이터, Discovery 단계 화합물의 약효 / DMPK / 독성의 Profiling 데이터를 등록 및 다운로드할 수 있습니다.
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KBI 바로가기 (Korea BioImaging)
MRI / fMRI / PET / CT / 초음파 / X-ray 등의 분자 영상 데이터, EEG / iEEG / MEG 등의 뇌파 데이터, 광학 및 전자현미경 데이터를 등록 및 다운로드할 수 있습니다.
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KPC 바로가기 (Korea Pre-Clinic)
전임상 시험은 새로 개발한 신약후보 물질 등을 세포 및 동물에게 시험 사용하여 부작용, 독성, 효과 등을 알아보는 시험입니다. 현재는 COVID-19 등 감염병에 대한 진단 시험, 백신 및 치료제 시험 데이터를 등록할 수 있습니다.
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GeNA 바로가기 (GeNeral Archive)
GeNA는 비정형 데이터 및 모든 형식의 데이터를 등록할 수 있는 generalist repository입니다. FigShare, Dryad, Zenodo 등의 유사 사이트처럼 범용 등록양식을 통해 간단히 데이터를 등록할 수 있습니다. 또한 의료기기, 생체신호, 독성 시험, 바이오 마커 등의 신약 데이터, 농약, 식품, 수산, 환경 등 특성 데이터를 등록할 수 있는 등록양식도 제공하고 있습니다.