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  • BioProject 딥러닝과 Au Nanopillar를 이용한 호흡기 바이러스 분류 개발

    코로나19를 비롯한 지속적인 바이러스 전염병과 계절성 인플루엔자의 위협이 상존하는 상황에서 신속하고 정확한 바이러스 균주 분류는 표적 치료 개입을 위해 필수적임. 이 연구는 딥러닝 기술과 표면 강화 라만 분광법(SERS)을 결합하여 SARS-CoV-2 변종(알파, 베타, 감마, 델타, 오미크론, 뮤), 인플루엔자 A(H1N1, H5N3), 인플루엔자 B를 포함한 호흡기 바이러스를 식별함으로써 바이러스를 분류하고 향후 치료 방향을 제공하는 혁신적인 접근법을 제시함. 우리는 바이러스 검출 감도를 높이기 위해 새로운 Au 나노필러 SERS 기판을 개발했음. 이 기판은 바이러스 입자를 매우 민감하게 검출할 수 있으며, 1D 컨볼루션 신경망(1D-CNN)을 사용한 딥러닝과 결합하면 6개의 SARS-CoV-2 균주, 2개의 인플루엔자 A 균주 및 인플루엔자 B 균주를 성공적으로 식별할 수 있음. 또한 이 연구에서는 1D-CNN 프레임워크 내에서 Grad-CAM 방법을 사용하여 이러한 바이러스의 고유한 라만 시그니처를 조사 함. 이 연구는 데이터 수집, 전처리, 모델 훈련, 스펙트럼 분석 등 다양한 단계를 포함함. 분류 시스템의 견고성을 보장하기 위해, 다양한 바이러스 샘플 데이터 세트가 사용됨. 1D-CNN은 호흡기 바이러스 분류에서 놀라운 정확도와 특이성을 보여주었음. Grad-CAM 방법을 사용한 라만 시그니처 조사는 호흡기 바이러스의 고유한 분자 및 구조적 특징에 대한 귀중한 통찰력을 제공함. 이러한 발견은 특정 바이러스 균주에 대응하도록 설계된 항바이러스제 및 백신과 같은 개인 맞춤형 치료 전략의 개발을 안내할 수 있는 잠재력을 갖고있을 것이라 사료됨. 이 혁신적인 접근 방식은 호흡기 바이러스 발병의 조기 발견과 관리를 개선할 뿐만 아니라 공중보건 대응에도 크게 기여할것이라 기대함. 의료 전문가, 연구자, 공중 보건 기관에 바이러스 전염병에 효과적으로 대처할 수 있는 고급 툴셋을 제공함. 결론적으로, 이 연구는 호흡기 바이러스 분류 및 고유한 라만 시그니처 탐색을 위한 1D-CNN 프레임워크 내에서 Au 나노필러 SERS 기판, 딥러닝 기술 및 Grad-CAM 방법의 통합을 입증함. 이러한 다학제적 접근 방식은 호흡기 바이러스 발생에 대처하는 능력의 중요한 발전을 의미하며 맞춤형 치료 개입의 기초를 제공할것이라 기대함.

    Project ID KAP241012
    NTIS 번호 1415184122
    공개 일자 2024-11-25
    데이터 타입
    감염병 진단 전임상 시험 데이터
  • BioProject 감염병 진단 플랫폼 기술 임상평가 시스템 구축

    1. 신변종 병원체 유행을 대비하는 임상 증상별, 해부학적 위치별 검체 수집 및 검사 대상물내의 미생물총 염기서열 분석 2. 다제내성세균의 분리, 동정 및 표현형/유전형적 특성 확인: 실험균주 패널 구성 3. 최종 개발된 플랫폼을 이용한 병원체 검출 기술 평가 o 1차년도 - 중증감염이 의심되나 배양검사 및 기타 분자진단검사에서 음성인 환자의 증상과 연관된 해부학적 위치의 검체를 수집하고 이에 대한 shotgun sequencing을 수행하여 unknown pathogen을 검출하기 위하여 여러 파이프라인을 비교 평가 o 2차년도 - 임상미생물검사실에서 분리되는 위 6종과 그 밖에 모든 항균제에 내성을 보이는 슈퍼박테리아를 대상으로 표현형적 분석 및 유전형적 분석을 시행하여 역학적인 균주 분류 및 내성기전을 확인하고 이를 바탕으로 냉동보관하여 바이오뱅크를 구축 - 개발에 필요한 pilot strain 제공 - unknown pathogen을 검출하기위한 최적의 shotgun sequencing을 선택하여 파이프라인을 셋팅 o 3차년도 - 신변종병원체 유행을 대비하여 심각한 감염 환자의 검체 수집, 미생물총분석 및 냉동 보관 - 다제내성세균 및 confounder 포함한 final panel 구성 - 시제품의 검출 성능 및 임상사용편리성포함 평가 및 피드백 - shotgun sequencing을 통해 unknown pathogen여부 모니터링 o 4차년도 - 1세부, 2세부에서 개발된 시스템을 병원체 검출 기술을 실제 신변종바이러스 및 다제내성세균에 적용하여 기술 검증

    Project ID KAP241588
    NTIS 번호 1711141355
    공개 일자 2025-08-27
    데이터 타입
    감염병 진단 전임상 시험 데이터
  • BioProject 면역조절 영장류 모델의 혈액학적(헤마톨로지) 분석

    본 연구는 국가 재난형 신·변종 감염병에 선제 대응하기 위해, 산·학·연에서 직접 활용 가능한 영장류 감염모델을 개발·고도화하고, 면역조절 조건에서의 혈액학적(헤마톨로지) 지표를 체계적으로 수집·분석하여 표준화된 데이터셋으로 구축한다. 본 연구 결과는 향후 백신, 치료제 평가, 면역독성, 면역 안전성 판독 등 공동연구와 기술이전에 활용 가능할 것으로 여겨진다.

    Project ID KAP241666
    NTIS 번호 2710087136
    공개 일자 2025-09-24
    데이터 타입
    감염병 진단 전임상 시험 데이터
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