본문으로 바로가기

통합 검색

통합검색 배경이미지

    인기검색어 인기 검색어 #Cancer #Homo Sapiens #Covid

    "KAP241505"에 대한 결과가 3건 검색되었습니다.
    BioProject
    BioProject

    단백체
    단백체 데이터

    전체 1건 중 1-1
    • BioProject 다중 및 심층 단백질체 프로파일링을 위한 Narrow-Window DIA와 Isobaric Labeling 결합 분석법

      DIA (Data-independent acquisition, DIA 질량분석법은 선택된 질량대비전하비 (m/z) 범위 내에서 사전에 정의된 isolation 윈도우를 통해 모든 precursor ion을 체계적으로 분해하는 강력한 분석 기법으로 부상하고 있다. DIA는 이온의 세기에 따라 전구체를 선택하는 DDA (Data-dependent acquisition) 방식과 달리, 낮은 intensity 펩티드에 대해서도 향상된 식별 및 정량 기회를 제공하여 단백질체 coverage를 크게 향상시킨다. 그러나 현재까지의 DIA 기법은 isobaric 표지된 펩티드에 대해서는 널리 적용되지 못했는데, 이는 co-isolation로 인한 reporter ion의 간섭의 영향으로 정확한 정량이 어렵기 때문이었다. 본 연구에서는 narrow-window DIA와 isobaric 표지 기법을 통합한 최적화된 DIA 방식을 제시하며, 이를 Orbitrap Astral 질량분석기를 사용하여 분석하였다. 최대 200 Hz에 달하는 초고속 데이터 획득 속도와 80K 해상도의 고해상도 MS/MS 스캔 성능을 활용하여, 0.6 Th의 narrow-window isolation를 구현함으로써 DDA에 필적하는 높은 isolation specificity를 달성할 수 있었다. 본 연구는 18plex-TMTpro 표지된 난소암 조직 유래 펩티드를 이용하여 제안한 방법의 성능을 평가하고, 이를 기존 DDA 기반 분석법과 비교하였다. 그 결과, narrow-window DIA 방법은 일관되게 더 많은 수의 펩티드를 식별하여 보다 심층적인 단백질체 coverage를 달성하는 동시에, 정량적 정밀도와 정확도 또한 DDA와 동등한 수준을 유지함을 확인하였다. 이 포괄적인 접근법은 다중 샘플을 동시에 분석하는 multiplexed proteomics 연구에서 크게 향상된 성능을 제공하며, 향후 대규모의 population proteomics 연구에 있어 효과적인 분석방법을 제시한다.

      Accession [KAP241505]
    Database
    • MOBiDIC (해양수산부) 0
    • NABIC (농촌진흥청) 0
    • NNIBR (기후에너지환경부) 0
    • CODA (질병관리청) 0
    • NCDC (국립암센터) 0
    • 통합데이터지도 0