KNA legacy(~2024)
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AccessionKNA1000000638
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Submission date2024-02-15
Project Detail
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BioProject
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KAP240612 |
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프로젝트의 영문 제목
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Standard cooperation center for quality control of mouse microbes
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프로젝트의 영문 설명
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Through the provision of standardized mouse microbiome materials, we contribute substantively to the advancement of diagnostic kits for mouse health monitoring. This endeavor aims to optimize quality control in bioscience by harnessing health monitoring information services, thereby enhancing the precision and reliability of experimental outcomes. The active support for mouse health monitoring not only acts as a preemptive measure against infectious diseases in experimental animals but also serves to safeguard invaluable lives. Additionally, it significantly mitigates the temporal and economic losses associated with repetitive experiments. Ultimately, these efforts contribute to the fortification of competitiveness within the bioscience domain.
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등록자의 영문 이름
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Choi Yang-Kyu
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DataSet
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염기서열 형식
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Assembled sequences (each sequence was assembled from two or more overlapping sequence reads)
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데이터 등록 형식
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Whole genome sequences
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어셈블리 일자
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어셈블리 방식
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Other (Please specify) - Trycycler
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프로그램 버전
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v0.5.3
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어셈블리명
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게놈 커버리지
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749.029296414696 x
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전체 원시데이터 길이
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1948251416
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총 염기서열 read 수
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257580
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전체 contig 수
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1
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전체 contig 길이
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2601035
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N50
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2601035 bp
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시퀀싱 기술
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Oxford Nanopore MinION
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전체 게놈 포함 여부 확인
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Yes (even for draft genomes or if a prokaryotic genome assembly may not include plasmids)
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게놈 영역 설명
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최종버전 여부
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Yes
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드 노보 어셈블리 여부
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Yes
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참조 어셈블리 이름
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업데이트 여부
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No
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기존 게놈 등록번호
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분자 유형
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위상
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원천 소기관/위치 정보
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키메라 서열 확인
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키메라 확인 프로그램명
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키메라 확인 프로그램 버전
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배양 여부
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프라이머 유형
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포워드 프라이머명
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포워드 프라이머 시퀀스
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리버스 프라이머명
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리버스 프라이머 시퀀스
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Coding region (CDS) / Gene / mRNA
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RNA
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Repeat sequence / mobile element / satellites
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Regulatory feature
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Others
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Reference file
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공개날짜
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어셈블리 상태
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비배치 스캐폴드 AGP 파일 유무
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비위치화 스캐폴드 AGP 파일 유무
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AGP 이용 조립방법
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AGP 주석 유무
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염기서열 파일 포맷
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FASTA
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공개날짜
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2024-05-16
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| File Name | Size | Type | Published | Download | |
|---|---|---|---|---|---|
| Cbovis2.fasta | 2,644,409 2,644,409 | fasta | 2024-05-16 | ||
| Cbovis2.gff | 3,158,104 3,158,104 | gff | 2024-05-16 |