KNA legacy(~2024)
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AccessionKNA1000000165
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Submission date2023-02-17
Project Detail
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BioProject
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KAP240283 |
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프로젝트의 영문 제목
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Development of non-culture based rapid multiplex diagnostic system for detection of major Aspergillus species and azole-resistance in invasive aspergillosis
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프로젝트의 영문 설명
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This study developed a non-culture molecular diagnostic method for species identification and rapid diagnosis of azole-resistance in invasive aspergillosis with a high mortality rate, and evaluated the clinical utility of the developed diagnostic method. Using this, we intend to lay the foundation for overcoming intractable diseases by presenting a clinically standardized diagnostic protocol.
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등록자의 영문 이름
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Kim Won-Bok
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DataSet
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염기서열 형식
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Assembled sequences (each sequence was assembled from two or more overlapping sequence reads)
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데이터 등록 형식
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Single sequence
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어셈블리 일자
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어셈블리 방식
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프로그램 버전
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어셈블리명
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게놈 커버리지
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전체 원시데이터 길이
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총 염기서열 read 수
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전체 contig 수
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전체 contig 길이
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N50
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시퀀싱 기술
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전체 게놈 포함 여부 확인
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게놈 영역 설명
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최종버전 여부
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드 노보 어셈블리 여부
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참조 어셈블리 이름
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업데이트 여부
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기존 게놈 등록번호
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분자 유형
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genomic DNA
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위상
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Linear
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원천 소기관/위치 정보
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chromosomal
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키메라 서열 확인
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No
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키메라 확인 프로그램명
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키메라 확인 프로그램 버전
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배양 여부
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Pure-cultured strains (axenic cultures containing only one microbial species each)
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프라이머 유형
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포워드 프라이머명
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포워드 프라이머 시퀀스
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리버스 프라이머명
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리버스 프라이머 시퀀스
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Coding region (CDS) / Gene / mRNA
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RNA
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Repeat sequence / mobile element / satellites
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Regulatory feature
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Others
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Reference file
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공개날짜
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2023-02-17
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어셈블리 상태
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비배치 스캐폴드 AGP 파일 유무
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비위치화 스캐폴드 AGP 파일 유무
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AGP 이용 조립방법
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AGP 주석 유무
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염기서열 파일 포맷
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공개날짜
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| File Name | Size | Type | Published | Download | |
|---|---|---|---|---|---|
| CMC_F493.fasta | 2,019 2,019 | fasta | 2024-03-21 | ||
| CMC_F493.xlsx | 6,257 6,257 | xlsx | 2024-03-21 |