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NGS에 의한 미생물 유전체의 해독 결과물은 종종 낮은 품질의 조립 결과물을 만들어 냅니다. 많은 경우에 분석 균주가 다른 것으로 오염되어 있어서 이와 같은 결과를 초래하게 됩니다. 다른 미생물에 의한 오염은 실험 과정에서 흔히 일어나는 일이지만 간혹 균주 stock이 순수하지 않아서 일어날 수도 있습니다. 여기에서는 바이오프로젝트 'Genome sequencing of microbial strains collected by Korean Collection for Type Cultures'와 동일한 연구 과정에서 생성된 Illumina HiSeq 2000 sequencing raw data 중에서 오염 등의 문제로 인해 후속 분석에 쓰기 곤란한 것 8건과 QC와 관련한 분석 결과물을 참조용으로 소개하고자 합니다. Read 수준에서는 jellyfish를 이용한 21-mer abundance analysis 및 phyloFlash를 이용하여 전장 16S rRNA를 확인하였고, ZGA pipeline으로 조립하는 과정에서 CheckM에 의한 점검을 거쳤습니다.