이전 사이트 이동

대장균 W 균주(ATCC 9637)의 유전체는 Roche/454 pyrosequencing과 Sanger sequencing의 혼성 방법으로 완전히 해독되었습니다. 약 27.7x 배수로 생산한 Roche/454 pyrosequencing read를 gsAssembler로 조립하여 200여 개의 contig를 만들었고, 이는 가상 read로 전환한 뒤 fosmid end reads(Sanger)와 함께 조립하여 스캐폴드를 구성하였습니다. 갭 영역에 대한 PCR product의 end sequencing, primer walk, 그리고 다소 난이도가 높았던 2개의 prophage copy에 대한 면밀한 재구성 작업을 거쳤습니다. 본 바이오프로젝트는 Sanger read와 Phred/Phrap/Consed 파이프라인으로 만든 최종 조립물을 제공하는 것이 목적입니다. Roche/454 pyrosequencing 원데이터는 이미 KAP240861로 등록된 상태입니다. 완성된 유전체 서열은 일루미나 GAII에 의한 폴리싱 작업을 거쳐서 GenBank에 등록되었으므로, 본 바이오프로젝트에서 제공하는 최종 결과와 다를 수 있습니다.