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1995년 우리나라에서 재배된 보리 뿌리에서 분리된 미생물인 Paenibacillus polymyxa E681은 다양한 작물에 대하여 탁월한 효과를 나타내는 식물성장촉진 근권 미생물입니다. 21C 프론티어 미생물유전체활용기술개발사업단의 성과 중 하나인 E681의 유전체 정보(GenBank CP000154)는 많은 후속 논문과 특허, 특히 E681이 만들어내는 항생물질 등 다양한 이차대사물의 연구에 폭넓게 활용되어 왔습니다. 이 BioProject는 E681 유전체 해독을 위해 한국생명공학연구원과 (주)제노텍에서 2000년대 초반 Sanger 시퀀싱 기술로 생성한 모든 Sanger sequencing read와 Phred/Phrap/Consed 파이프라인으로 만든 조립 결과를 제공함을 목적으로 합니다. 작업 디렉토리(PP/edit_dir) 안에서 Consed를 실행하면 각 서열 단편이 contig 위에 어떻게 정렬하는지, gap closing 및 quality 개선을 위한 PCR 실험은 어떻게 설계되었는지 등에 관한 정보를 얻을 수 있습니다. 또한 Consed의 부속 소프트웨어를 사용하여 PHD 파일로부터 서열 단편 정보를 FASTA(+quality) 파일로 전환한 뒤, Phrap이나 Cap3 등의 소프트웨어를 사용하여 직접 유전체 조립 연습을 해 볼 수도 있습니다.