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Leuconostoc citreum KM20(= KCTC 10512BP)은 10℃에서 발효한 김치로부터 분리한 유산균으로, 암세포 생장 억제 및 다수의 병원성 미생물의 생육을 억제하는 효과가 있는 것으로 알려져 있습니다. 현재 이 균주를 이용한 꿀벌 병해충 방제용 조성물 등 2건의 국내 특허가 등록되어 있습니다. KM20 균주는 21C 프론티어 미생물유전체활용기술개발사업단 공통기반과제의 유전체 해독 대상으로 선정되어 Sanger sequencing 기법을 이용, 염색체와 4개의 플라스미드에 대한 염기서열을 완전히 해독한뒤 2008년 논문으로 발표되었습니다. 이 바이오프로젝트의 목적은 Leuconostoc citreum KM20의 유전체 프로젝트에서 수행을 위해 Phred/Phrap/Consed 파이프라인으로 만든 최종 조립물을 제공하는 것입니다. 안타깝게도 raw data에 해당하는 크로마토그램 파일은 남아 있지 않으나, 작업 디렉토리(LC/edit_dir) 안에서 Consed를 실행하면 각 서열 단편이 contig 위에 어떻게 정렬하는지, gap closing 및 quality 개선을 위한 PCR 실험은 어떻게 설계되었는지 등에 관한 정보를 얻을 수 있습니다. 또한 Consed의 부속 소프트웨어를 사용하여 PHD 파일로부터 서열 단편 정보를 FASTA(+quality) 파일로 전환한 뒤, Phrap이나 Cap3 등의 소프트웨어를 사용하여 직접 유전체 조립 연습을 해 볼 수도 있습니다