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Hahella chejuensis 96CJ10356T(= KCTC 2396T)는 대한민국의 최남단 섬인 마라도에서 분리된 그람 음성 세균으로 대량의 세포외다당과 적소생물(Cochlodinium polykrikoides) 살상 능력이 있는 물질인 프로디지오신을 생성하는 해양 미생물입니다. 이 세균은 21C 프론티어 미생물유전체활용기술개발사업단 공통기반과제의 첫 유전체 해독 대상으로 선정되어 Sanger sequencing 기법을 사용하여 7.2 Mb에 이르는 유전체 염기서열을 완전히 해독, 발표하였습니다. 이 바이오프로젝트의 목적은 2003-2005년에 진행된 Hahella chejuensis 유전체 프로젝트의 유전체 조립 결과물을 제공하기 위함입니다. 안타깝게도 당시에 ABI 3700/30 및 RISA-384에서 만들어진 크로그토그램 파일은 남아있지 않으나, Phred/Phrap/Consed 소프트웨어를 사용하여 최종 완성물을 만들었던 그 외의 작업 파일(PHD 및 ACE 파일)은 고스란히 보존되어 있습니다. 따라서 Consed를 사용하면 각 서열 단편이 contig 위에 어떻게 정렬하는지, gap closing을 위한 PCR 실험은 어떻게 설계되었는지 등에 관한 정보를 얻을 수 있습니다. 또한 Consed의 부속 소프트웨어를 사용하여 PHD 파일로부터 서열 단편 정보를 FASTA(+quality) 파일로 전환한 뒤, Phrap이나 Cap3 등의 소프트웨어를 사용하여 직접 유전체 조립 연습을 해 볼 수도 있습니다. 아무쪼록 이 '유산' 자료를 통하여 NGS 이전 시대의 유전체 해독 프로젝트가 어떻게 이루어졌는지 경험해 보시기 바랍니다.